怀孕初期断断续续有褐色分泌物可能是以下原因导致。
一、先兆流产：这通常表现为伴有轻微下腹痛的少量阴道出血，如果出血腹痛进一步加重，就可能进展为难免流产。针对这种情况，一般需要在医生指导下进行处理，比如口服黄体酮、地屈孕酮等药物或注射黄体酮针，同时要定期复查超声，以观察胎心胎芽的生长情况。
二、正常现象：在怀孕初期，出现褐色分泌物可能是正常的一种情况，即胚胎着床后，由于子宫内膜局部被破坏而出现少量出血，量少的话就会呈现为褐色分泌物。这种情况通常不需要治疗，一般持续2至3天后，子宫内膜会自行修复，流血就会停止。
三、宫外孕：宫外孕的特点是有褐色分泌物以及腹痛且持续加重。对于宫外孕必须及时处理，不然会有很大危害。通常需要尽快到正规医院进行诊断，找到病因后采取有效措施进行治疗，如此才能避免对女性健康造成更严重的伤害。
总之，怀孕初期出现断断续续褐色分泌物的原因多样，要根据具体情况进行判断和处理，以保障孕妇和胎儿的健康安全。