孕酮低的原因包括胚胎发育本身的因素、黄体功能不全的因素，同时正常妊娠状态的女性也可能出现孕酮低的情况。
一、胚胎发育本身问题：如果孕妇感染了风疹病毒、巨细胞病毒或单纯疱疹病毒等，这些病毒感染都有可能导致胚胎染色体出现异常，进而使得孕酮偏低，最终引发胚胎停育。
二、黄体功能不全：内分泌发生紊乱，致使排卵以及黄体功能出现异常，就会造成孕酮降低，若没有及时补充，很可能导致胚胎停育。
三、正常妊娠状态：处于怀孕期间的女性，孕酮数值在妊娠早期是呈脉冲式分泌的，有时候会在十几到二十几之间上下起伏波动，甚至波动范围能达到5至6倍之多。在临床当中，这可能会给人造成孕酮低的假象。然而这种状况属于正常生理情况，不必过于忧虑，只要持续进行观察即可。但当患者有腹痛或出血等症状出现时，就应该高度警觉，要及时就诊并展开治疗。
总之，孕酮低的情况较为复杂，需要根据具体情况进行分析和处理，对于孕妇出现的异常症状要及时关注和治疗。