药流后头疼的原因包括正常现象，也可能与代谢功能问题、药流后大出血等相关。
一、正常现象：用于药物流产的药物往往会有副作用，可能引发患者头疼。这种副作用在不同患者身上表现各异，因个体差异，有些患者对药物较为敏感，其头疼程度可能相对更严重。
二、代谢功能问题：药物进入患者体内后，都需经肝脏代谢再经肾脏排出。若患者肝功能或肾功能出现异常，就会导致药物在体内停留时间延长，使得药物持续发挥作用，进而刺激中枢神经系统，从而造成患者药物流产后的头疼。
三、药流后大出血：药流后大量出血会引起脑供血不足，以及身体疲劳，进而导致头疼。
当出现药流后头疼时，应尽快就医，由医生明确病因，必要时给予相应治疗。
总结概况提示：药流后头疼的原因多样，有正常的药物副作用，也可能因代谢功能障碍或大出血等引起，出现头疼应及时就医明确原因和治疗。