月经第3天查激素六项的参考范围如下：
一、卵泡刺激素和促黄体生成素：在月经第3天处于卵泡早期，这两种激素正处于低水平期，数值最低，基础值为5～10IU/L。通常在怀疑女性有内分泌紊乱疾病时，可在此时期进行激素六项检查，以了解性腺轴功能、卵巢功能是否正常。
1.卵泡刺激素：对生殖功能起到重要作用。
2.促黄体生成素：与卵泡刺激素协同调节生殖系统。
二、孕酮：月经第3天卵泡水平较低，孕酮的基础值一般小于1ng/ml。
三、催乳素：这是一种较不稳定的激素，受多种因素如运动、情绪、月经不调等影响，其数值不完全确定，但多数情况下催乳素小于25ng/ml被视为正常。
四、雌二醇：月经第3天的数值大概在25～50pg/ml，此时处于早卵泡水平。
五、总睾酮和游离睾酮：月经第3天，总睾酮数值为0.21～3.01nmol/L，游离睾酮数值是(11±2)pmol/L。
总之，在月经第3天进行激素六项检查时，可依据上述参考范围来评估女性的性腺轴功能、卵巢功能等相关状况。