严重川崎病会出现多种明显症状。一般来说，严重川崎病常表现为持续发热，体温多超过39℃，且发热时间通常会持续5天以上。
心血管系统症状表现
冠状动脉病变： 这是严重川崎病较为关键的心血管表现。部分患儿会出现冠状动脉扩张，严重时可形成冠状动脉瘤。据临床统计，约15% - 25%的川崎病患儿会发生冠状动脉病变，其中冠状动脉瘤的大小不一，小的可能仅轻微扩张，大的则直径明显增粗。心肌损害： 严重川崎病还可能影响心肌，导致心肌损害。患儿可能出现心率异常，如心动过速等情况，心电图检查可发现ST - T改变等心肌受损的表现。
其他系统症状表现
眼部症状： 眼睛会出现球结膜充血，一般是双侧球结膜充血，且没有脓性分泌物。这种充血会持续较长时间，在疾病的发热期较为明显。口唇及口腔症状： 口唇充血皲裂，口腔黏膜会出现弥漫性充血，舌头表现为杨梅舌。这些口腔和口唇的改变也是严重川崎病的典型表现之一，会给患儿带来不适，影响进食等。皮肤症状： 皮肤会有多形性红斑和猩红热样皮疹等表现。多形性红斑的皮疹形态多样，可分布在身体多个部位；猩红热样皮疹则类似猩红热患者的皮疹表现，一般在发热期出现，随着病情变化皮疹状态可能有所改变。
急性期的全身表现
发热持续不退： 严重川崎病的发热往往是持续性的，体温很难通过一般的退热措施快速降至正常，并且发热时间较长，超过5天仍不缓解是严重川崎病的一个重要特征。颈部淋巴结肿大： 颈部会出现非化脓性的淋巴结肿大，淋巴结通常直径多在1.5cm以上，单侧或双侧均可发生，但一般以单侧多见，质地较硬，表面不红，无化脓表现。