怀孕12周时孕酮低，可能会增加流产、先兆早产等风险，还可能影响胎儿的发育。具体如下：
1.增加流产风险：怀孕12周时，胎盘已经形成，孕酮主要由胎盘分泌。如果孕酮水平低，可能会导致胎盘功能不全，影响胚胎的发育，增加流产的风险。
2.先兆早产：孕酮低还可能导致子宫平滑肌兴奋性增加，诱发子宫收缩，增加先兆早产的风险。
3.影响胎儿发育：孕酮低可能会影响胎儿的生长发育，导致胎儿发育迟缓、畸形等问题。
如果怀孕12周时孕酮低，需要及时就医，医生会根据具体情况采取相应的治疗措施，如补充孕激素、卧床休息等。同时，孕妇要注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持良好的心态，积极配合医生的治疗。
需要注意的是，每个孕妇的情况都不同，孕酮低的危害也因人而异。如果对孕酮水平或其他孕期问题有任何疑问，建议及时咨询医生，以获得个性化的建议和指导。