运动后小腿后侧肌肉疼痛多是由运动相关因素引起，比如运动强度突然增加等，一般来说可能是以下几种情况导致。
肌肉拉伤所致
运动前未充分热身：当运动前没有进行5 - 10分钟的热身活动，肌肉的伸展性和弹性不够，突然进行剧烈运动，就容易导致小腿后侧肌肉拉伤，从而引起疼痛。例如进行快跑、跳跃等运动时，若热身不充分，就较易出现这种情况。运动过度：长时间、高强度的运动，会使小腿后侧肌肉疲劳，代谢产物堆积，如乳酸等，当乳酸堆积到一定程度就会刺激肌肉神经，引发疼痛。比如连续跑步超过30分钟且速度较快时，就可能出现这种情况。
肌腱炎引发
频繁重复运动：一些需要频繁进行小腿屈伸动作的运动，像芭蕾舞演员的踮脚动作、长跑运动员的反复蹬地等，会使小腿后侧肌腱反复受到牵拉，长期下来容易引发肌腱炎，出现疼痛症状。例如芭蕾舞演员每天大量的踮脚训练，就容易患上小腿后侧肌腱炎。姿势不正确：运动时姿势不正确，如跑步时膝盖内扣、落地姿势不当等，会改变小腿后侧肌腱的受力分布，增加肌腱的损伤风险，进而引发肌腱炎导致疼痛。比如跑步时过度内八字落地，就可能影响小腿后侧肌腱的正常受力。
筋膜发炎引起
运动环境不佳：在过硬的地面上运动，如水泥地等，小腿后侧筋膜受到的冲击力较大，容易引发筋膜发炎。例如在水泥地上进行长时间的跳绳运动，就可能因为地面过硬导致筋膜发炎而疼痛。身体体质因素：本身身体柔韧性较差的人，运动时肌肉筋膜的伸展性受限，在运动过程中更容易出现筋膜的损伤和炎症，从而引起小腿后侧肌肉疼痛。比如柔韧性较差的人进行瑜伽的下犬式等动作时，就可能比柔韧性好的人更易出现小腿后侧筋膜发炎疼痛的情况。