口腔溃疡可以使用局部用药来缓解，比如西瓜霜喷剂，一般喷后几分钟就能起到一定的止痛、促进愈合作用。
局部外用药
含漱剂： 氯己定含漱液是比较常用的，它能杀菌消炎，一般每天含漱2 - 3次，每次含漱10 - 30秒左右。还有康复新液，也可用来含漱，能促进创面愈合。含片： 西地碘含片，含服时慢慢溶解，能起到杀菌、抗感染的作用，一般一天含服3 - 5次。溶菌酶含片也有抗菌消肿的功效，含服即可。
促进愈合的药物
贴膜类： 醋酸地塞米松粘贴片，将其贴在溃疡面上，能起到抗炎、抗过敏的作用，一次用一片，每天不超过3片。复方庆大霉素膜也是常见的贴膜，能减轻疼痛，促进溃疡愈合。散剂： 冰硼散，适量吹敷于溃疡处，能起到清热解毒、消肿止痛的效果，但小孩使用时要注意避免误吸。珠黄散也可用于口腔溃疡，有清热、解毒、祛腐的作用。
口服药物
维生素类： 维生素B2，适当补充能参与机体的代谢，对预防和治疗口腔溃疡有一定帮助，一般成人每天服用3次，每次5毫克左右。维生素C也有辅助作用，能增强机体抵抗力，促进伤口愈合，成人每天可服用100 - 300毫克，分多次服用。免疫调节类： 对于反复发作、症状较重的口腔溃疡患者，可能会用到转移因子胶囊等免疫调节药物，但这类药物需要在医生的指导下使用，因为它有一定的适应证和禁忌证，比如孕妇和哺乳期女性使用时要谨慎。还有左旋咪唑，也可用于免疫功能低下引起的口腔溃疡，但儿童使用时要严格遵循医生的建议。