怀孕50天流褐色分泌物可能与以下因素有关：
一、先兆流产
1.原因：导致先兆流产的原因较为复杂，可能和黄体酮水平、甲状腺激素水平等有关。
2.症状表现：患者除有流褐色分泌物外，还可能伴有下腹坠痛、胀痛等症状。
3.处理措施：建议患者立即前往医院，遵医嘱使用黄体酮、丙硫氧嘧啶等药物进行干预。
二、子宫内膜脱落
1.原因：因个体差异，有些女性怀孕后卵巢分泌的性激素，特别是孕激素水平相对较低，致使一小部分子宫内膜仍持续脱落。
2.症状表现：临床检查会发现流褐色分泌物。
三、宫外孕
1.定义：宫外孕是指孕卵在子宫腔外着床发育的异常妊娠过程。
2.症状表现：常有不规则阴道出血，色暗红、量少、淋漓不尽等情况，一般不超过月经量，可随阴道出血排出蜕膜管型或碎片，临床检查可见流褐色分泌物。
怀孕50天流褐色分泌物还可能存在其他原因，患者应及时前往医院，根据医嘱进行对症处理。
总结：怀孕50天流褐色分泌物的原因包括先兆流产、子宫内膜脱落、宫外孕等，每种情况都有其特定的表现和处理方式，当出现这种情况时应尽快就医，以便明确原因并采取合适的治疗措施。