尿道口神经性疼痛能否自愈不能一概而论，部分轻微情况有一定自愈可能，但也有不少情况需要干预。一般来说，约30%左右症状较轻且诱因可去除的尿道口神经性疼痛有自愈倾向，但多数还是需要积极处理。
诱因与自愈的关系
局部刺激因素： 如果尿道口神经性疼痛是因短暂的局部摩擦刺激引起，比如穿着过紧的内裤摩擦到尿道口，在更换宽松舒适内裤后，避免持续摩擦，可能在1 - 2周内逐渐自愈。但要是持续受到摩擦等刺激，就很难自愈，还可能加重症状。心理因素： 部分人因精神紧张、焦虑等心理因素导致的尿道口神经性疼痛，若能自我调节好情绪，保持心情放松，约有40%的人在1个月内可能自愈。然而如果长期处于高度紧张焦虑状态，心理因素持续存在，就难以自愈，疼痛可能会迁延不愈。
不同人群的自愈差异
年轻人： 年轻人身体机能较好，若尿道口神经性疼痛是短期接触过敏原等较轻原因引起，自身免疫力能较快发挥作用，约50%的年轻患者有自愈可能，时间大概在2 - 4周。但如果是本身有基础疾病导致的相关神经性疼痛，自愈可能性就小。老年人： 老年人身体各项机能衰退，自身修复能力减弱，因慢性病等因素引发的尿道口神经性疼痛，自愈的概率较低，可能不足10%，往往需要通过药物等干预措施来缓解疼痛。
伴随症状对自愈的影响
无其他明显伴随症状： 当尿道口神经性疼痛不伴有尿道分泌物增多、发热等其他明显异常时，相对较容易出现自愈情况，尤其是诱因明确且能快速消除的，自愈几率能达到30% - 50%。伴有其他明显症状： 如果尿道口神经性疼痛同时伴有尿道分泌物增多、尿频、尿急甚至发热等症状，说明可能存在感染等较复杂情况，几乎不可能自愈，必须及时就医进行相应检查和治疗，比如进行尿常规、分泌物涂片等检查来明确病因，然后采取针对性的治疗措施。