急性咽炎多由病毒或细菌感染引起，常用的药物有抗病毒药物和抗生素等。一般来说，病毒感染引起的急性咽炎可使用利巴韦林等抗病毒药物，而细菌感染导致的急性咽炎则可能需要用青霉素类或头孢类抗生素。
抗病毒药物选择
利巴韦林： 可抑制病毒核酸合成，对多种病毒有抑制作用，能缓解病毒感染引起的急性咽炎症状。不过，孕妇及严重贫血患者禁用利巴韦林。阿昔洛韦： 属于广谱抗病毒药，能干扰病毒DNA多聚酶，抑制病毒复制。但对本品过敏者禁用，肾功能不全者需减量使用。
抗生素的使用情况
青霉素类抗生素： 如阿莫西林，适用于敏感细菌引起的急性咽炎。不过，对青霉素过敏者不能使用阿莫西林，使用前需做青霉素皮试。头孢类抗生素： 常见的有头孢拉定等。头孢类抗生素抗菌谱较广，对多种细菌有抑制作用。但使用头孢类药物期间及停药7天内禁止饮酒，以免引起双硫仑样反应。
对症治疗药物
含漱液： 复方硼砂含漱液可清洁口腔，减轻炎症。使用时需按说明书稀释后含漱。含片： 如碘喉片，能杀菌、收敛、消炎，缓解咽部疼痛等症状。但对碘过敏者禁用碘喉片。
特殊人群用药注意
儿童患者： 儿童使用抗病毒或抗生素药物时需谨慎，应根据体重等因素调整剂量。例如，儿童使用阿莫西林时，需按照儿童剂量标准来使用，且要密切观察用药后的反应。孕妇患者： 孕妇患急性咽炎时用药更需谨慎，抗病毒药物如利巴韦林孕妇禁用，抗生素的选择也需权衡利弊，尽量选择对胎儿影响小的药物，必须在医生指导下用药。