滤泡性咽炎可以通过一般治疗、药物治疗、物理治疗等方式来处理。一般来说，滤泡性咽炎的治疗需要综合多方面来进行。
一般治疗方面
生活习惯调整： 首先要注意保持口腔清洁，每天早晚刷牙，饭后漱口，这样可以减少口腔内细菌滋生，减轻对咽部的刺激。另外，要避免过度用嗓，比如长时间大声说话、唱歌等，让咽部得到充分休息。还要注意改善工作和生活环境，保持室内空气清新、湿润，避免长期处于粉尘、化学气体等污染环境中。饮食调整： 饮食上要避免食用辛辣、刺激性食物，像辣椒、花椒、生姜等，这些食物容易刺激咽部黏膜，加重滤泡性咽炎的症状。也要避免过烫、过冷的食物，多吃一些清淡、富含维生素的食物，例如新鲜的蔬菜（菠菜、西兰花等）和水果（苹果、橙子等），有助于维持咽部黏膜的健康。
药物治疗方面
局部用药： 可以使用含漱液，比如复方硼砂含漱液，它能清洁口腔、杀菌消炎，缓解咽部不适。还可以局部涂抹碘甘油，碘甘油有杀菌、收敛的作用，能减轻咽部的炎症反应，帮助滤泡消退。全身用药： 如果滤泡性咽炎是由细菌感染引起的，可在医生指导下使用抗生素，如青霉素类抗生素（不过要先做皮试，确保不过敏），但不能自行随意使用，必须根据病情由医生判断是否需要使用及选择合适的抗生素。如果是病毒感染引起的，一般需要使用抗病毒药物，如利巴韦林等，但同样要在医生的明确诊断后合理应用。
物理治疗方面
激光治疗： 对于滤泡较明显且药物治疗效果不佳的患者，可以考虑激光治疗。激光能通过产生的高温破坏滤泡组织，使其萎缩、消退。但激光治疗后要注意保持口腔清洁，避免感染，一般治疗后1 - 2周内要清淡饮食，减少对咽部的刺激。冷冻治疗： 冷冻治疗也是一种物理治疗方法，利用低温使滤泡组织坏死、脱落，从而达到治疗滤泡性咽炎的目的。冷冻治疗后可能会出现咽部轻微疼痛、肿胀等情况，通常在数天内会逐渐缓解，期间也要注意咽部的护理，遵循医生的术后注意事项。