怀孕三个月流产对身体的伤害主要体现为以下几方面：
一、生殖系统裂伤。怀孕达三个月已进入孕中期，此时胎儿已然成型，进行流产操作容易致使阴道和宫颈组织出现裂伤，进而引发出血、疼痛等状况。具体来说，由于此时胎儿体积相对较大，在流产过程中，需要通过扩张宫颈口等方式来将其排出，这就可能导致宫颈和阴道等部位受到过度的牵拉和扩张，从而造成裂伤，引起较为明显的出血症状，同时还会伴有疼痛，这种疼痛可能会持续一段时间，给孕妇带来较大的不适。
二、感染。怀孕三个月引产后，子宫出血的时间通常会比较长，在此期间若不注重卫生或是过度劳累、导致免疫力下降，就容易发生感染，出现频繁的肚子疼痛、分泌物增多且伴有异味等现象。比如，不注意外阴的清洁卫生，可能会使细菌等病原体容易侵入，引发感染；过度劳累会使身体抵抗力减弱，也为感染创造了条件。感染后，腹部疼痛可能会较为剧烈且持续，分泌物异常增多且可能散发难闻气味。
三、影响怀孕。如果因为流产而导致宫腔粘连或者输卵管堵塞，那么就会对以后的怀孕产生影响，甚至造成不孕。流产可能会对子宫内膜造成损伤，引起宫腔粘连，这会影响受精卵的着床和发育；而输卵管堵塞则会阻碍卵子和精子的结合以及受精卵的运输，从而大大降低受孕的机会，严重时可导致不孕。
总之，怀孕三个月流产对身体有诸多潜在危害，可能会造成生殖系统损伤、引发感染以及影响后续怀孕等，应谨慎对待。