宝宝口腔溃疡可能由多种原因引起。一般来说，宝宝口腔溃疡大约有10%-20%的概率是由于病毒感染导致的，比如疱疹性口腔炎，由单纯疱疹病毒引起。
局部创伤因素
创伤性摩擦： 宝宝在进食较硬的食物时，比如饼干、炒豆子等，可能会不小心擦伤口腔黏膜，从而引发口腔溃疡。比如有的宝宝吃比较脆的苹果块，就可能擦伤口腔内壁出现溃疡。牙齿萌出： 当宝宝处于牙齿萌出阶段时，如乳牙萌出，牙龈可能会有不适，有的宝宝会去咬嚼，也可能导致牙龈周围的口腔黏膜受损出现溃疡。一般在乳牙萌出的5-10个月左右，部分宝宝会出现因牙齿萌出导致的口腔溃疡情况。
缺乏营养物质
维生素缺乏： 尤其是维生素B族缺乏，会影响口腔黏膜的正常代谢，容易引发口腔溃疡。比如宝宝长期挑食、偏食，不爱吃蔬菜和水果，就容易缺乏维生素B2等，进而出现口腔溃疡。有研究发现，约30%的口腔溃疡患儿存在维生素B2水平低下的情况。微量元素缺乏： 像锌元素缺乏也与宝宝口腔溃疡有关。锌参与人体多种酶的合成，对维持黏膜健康很重要，宝宝如果锌摄入不足，就可能增加口腔溃疡的发生风险。
免疫系统因素
自身免疫反应： 虽然宝宝免疫系统还在发育中，但也可能出现自身免疫相关的口腔溃疡。如果宝宝免疫系统紊乱，可能会错误地攻击口腔黏膜组织，引发溃疡。不过这种情况相对较少见，但也是可能的原因之一。免疫力低下： 当宝宝身体免疫力较低时，比如生病后、过度疲劳等情况，就更容易受到病原体侵袭，从而引发口腔溃疡。比如宝宝患感冒后，身体抵抗力下降，就可能出现口腔溃疡。