怀孕40天选择药流有一定风险，但在符合条件的情况下相对安全。一般来说，药物流产常用的药物是米非司酮和米索前列醇，适用于妊娠≤49日、年龄小于40岁的健康女性。
药流的适用条件
妊娠天数限制： 药物流产要求怀孕时间在49天以内，也就是从最后一次月经第一天开始算，不超过49天，此时孕囊大小合适，进行药流相对更容易成功。身体状况要求： 女性需要身体健康，没有严重心、肝、肾疾病，没有肾上腺疾病、糖尿病等内分泌疾患，没有青光眼、哮喘等病史，且近3个月内没有接受过糖皮质激素治疗。
药流的风险与注意事项
流产不全风险： 药流有10%左右的流产不全概率，也就是服药后可能胚胎组织不能完全排出，需要再次清宫。一旦发生流产不全，可能会导致阴道大量出血，严重时会危及生命。出血时间较长： 药物流产后阴道出血时间一般较长，通常会持续1 - 2周，比人工流产出血时间长，这期间容易发生感染。
药流后的护理要点
观察出血情况： 药流后要密切观察阴道出血情况，如果阴道出血量多于月经量，或者出血时间超过2周，应及时就医。休息与饮食： 药流后要注意休息，一般建议休息2周左右。饮食上要加强营养，多吃富含蛋白质、维生素的食物，如瘦肉、鸡蛋、新鲜蔬菜水果等，帮助身体恢复。禁止性生活和盆浴： 在药流后的1个月内要禁止性生活和盆浴，防止细菌感染引起盆腔炎等妇科疾病。