指头长疣主要是感染人类乳头瘤病毒（HPV）引起的。HPV有多种亚型，其中引起指头长疣常见的是HPV - 2等亚型。
感染途径有哪些
直接接触传播： 比如直接接触到了长疣患者指头部位的疣体，就有可能被感染。要是和长疣的人共用毛巾、手套等个人物品，也容易通过这种间接的直接接触而被传染。自身接种传播： 自己身体其他部位有疣，比如手上其他部位有疣，用手去触碰指头的时候，就可能把病毒带到指头部位，从而引起指头长疣。
哪些人群更容易感染
免疫力低下者： 像患有艾滋病等免疫系统疾病的人，或者长期使用免疫抑制剂的人，他们的身体免疫力较弱，对HPV的抵抗力下降，就更容易感染HPV从而长疣。例如，长期服用糖皮质激素来控制病情的患者，相对来说感染长疣的风险会比正常人高。皮肤有破损者： 指头部位皮肤有破损的时候，比如被划伤、擦伤等，这时候皮肤的屏障功能受损，HPV就更容易侵入皮肤细胞，导致长疣。比如经常用手劳作，指头容易有小伤口的人群，像建筑工人、木工等，就比较容易感染长疣。
环境因素的影响
潮湿环境： 长期处于潮湿的环境中，比如经常接触水的工作，像渔民、经常洗碗的人等，指头皮肤长时间在潮湿状态下，有利于HPV的存活和感染。因为潮湿的环境为HPV的繁殖提供了一定条件，增加了感染长疣的几率。公共卫生条件差的场所： 在公共浴室、公共游泳池等公共卫生条件不太好的场所，如果皮肤接触到被HPV污染的水或者地面等，也容易感染。比如公共浴室的地面可能残留有长疣患者的病毒，其他人接触后就可能被感染长疣。