三个月婴儿头上出现硬疙瘩，原因可能有外伤、虫咬皮炎、毛囊炎等，治疗方式包括局部用药、口服药物等，具体如下：
一、外伤：婴儿较为活泼好动，容易发生外伤。当头部遭受撞击或碰撞坚硬物体后，可能会形成硬疙瘩。这种情况下硬疙瘩表面皮肤通常无开裂，涂抹擦伤膏一般可自行消退。
二、虫咬皮炎：若婴儿头部被蚊虫叮咬，蚊虫唾液注入皮肤会引发局部炎症改变，主要表现为红色风团样损害、红肿及瘙痒等症状。可遵医嘱局部使用炉甘石洗剂、氧化锌软膏等药物，能有效缓解症状。
三、毛囊炎：婴儿抗病能力较弱，头皮部位若受到细菌感染，易使毛囊出现炎症变化，主要有红色丘疹、肿大和疼痛等症状。可遵医嘱外用莫匹罗星软膏、红霉素软膏等消炎药物，可有效控制炎症。
此外，还可能是头皮感染、皮脂腺囊肿、脂肪瘤等原因导致，治疗方法还包括日常护理、物理方法等，具体需医生根据婴儿实际情况选择合适的方法。
总之，当三个月婴儿头上出现硬疙瘩时，要及时明确原因，以便采取针对性的治疗措施。