细菌性结膜炎通常可通过局部用药治疗，一般经过规范治疗1~2周左右可逐渐好转。
局部用药选择
抗生素眼药水：常用的有左氧氟沙星滴眼液，它能抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制，从而发挥杀菌作用；还有妥布霉素滴眼液，对多种革兰阳性菌及阴性菌有抗菌活性。一般白天可根据病情轻重，每1~2小时滴1次眼药水。抗生素眼药膏：像红霉素眼膏，在睡前涂抹能在眼部保持较长时间的药物浓度，起到持续抗菌的作用。
日常护理要点
眼部清洁：用生理盐水或3%硼酸溶液冲洗结膜囊，能清除眼部分泌物等，一般每天可冲洗1~2次。注意冲洗时要避免水流直接冲眼球，防止损伤。避免刺激：患病期间要避免戴隐形眼镜，同时要注意不要用手揉眼睛，防止加重感染。还要避免强光刺激，外出时可佩戴太阳镜。
特殊人群注意事项
儿童患者：儿童使用眼药水时要格外小心，滴药时要轻按泪囊区，防止药物经鼻泪管流入鼻腔吸收过多引起不良反应。比如2岁以下儿童使用抗生素眼药水需在医生严格指导下进行。孕妇患者：孕妇患细菌性结膜炎时，用药需谨慎，应选择对胎儿影响小的药物，如在医生评估后使用相对安全的眼药水，切不可自行随意用药。
治疗中的观察要点
症状观察：要密切观察眼部症状变化，如眼痛、畏光、分泌物等情况是否缓解。如果用药3天左右症状无改善甚至加重，如眼痛加剧、视力下降等，需及时复诊调整治疗方案。药物反应观察：留意使用眼药水后是否出现眼部瘙痒、红肿加重等过敏反应，如果有应立即停药并就医。