甲沟炎可以使用的药物有多种，一般轻度的甲沟炎可以用碘伏、鱼石脂软膏等。比如早期轻度甲沟炎，用碘伏每天消毒2~3次，能起到杀菌消毒的作用。
外用抗菌药物
碘伏： 它是常见的消毒剂，能够杀灭细菌、真菌等病原体。使用时用棉球蘸取适量碘伏，轻轻涂抹在甲沟炎患处，每天涂抹2 - 3次，能帮助预防感染进一步加重。莫匹罗星软膏： 属于抗生素软膏，对革兰阳性球菌有很好的抗菌活性。将莫匹罗星软膏薄涂于患处，一日3次，可用于治疗革兰阳性球菌引起的甲沟炎。
外用抗炎药物
鱼石脂软膏： 有温和的刺激性，具有消肿、消炎的作用。把鱼石脂软膏适量涂抹在甲沟炎红肿的部位，能促进炎症消退。一般一天涂抹1 - 2次。水杨酸软膏： 有一定的抗真菌和角质溶解作用。如果甲沟炎伴有局部角质增生等情况，可在医生指导下使用水杨酸软膏，但要注意避免接触周围正常皮肤。
特殊情况用药注意
儿童患者： 儿童患甲沟炎使用药物时要格外小心，比如儿童用碘伏相对安全，但使用莫匹罗星软膏等抗生素软膏时，需在成人监护下使用，且要注意药物的用量和使用部位。孕妇患者： 孕妇患甲沟炎用药更需谨慎，使用碘伏相对安全，而像莫匹罗星软膏等药物，在孕妇身上的安全性需医生评估后再使用，避免自行盲目用药对胎儿造成不良影响。