细菌性腹泻和病毒性腹泻在病因、症状表现和治疗等方面存在不同。一般来说，细菌性腹泻多由特定细菌感染引起，而病毒性腹泻常见的是轮状病毒等感染导致。
病因方面
细菌感染因素： 引起细菌性腹泻的常见细菌有大肠埃希菌、沙门菌等。例如，食用被大肠埃希菌污染的食物后，就可能引发腹泻。一般来说，食物保存不当、烹饪不彻底等情况容易让细菌有可乘之机。病毒感染因素： 病毒性腹泻常见的病毒是轮状病毒，主要通过粪 - 口途径传播，儿童更容易感染轮状病毒而引发腹泻，通常在秋冬季节高发。
症状表现不同
细菌性腹泻症状： 患者往往会出现腹痛比较明显的情况，大便多为黏液便或脓血便，可能还会伴有发热，体温有的可达到38℃~39℃甚至更高。比如感染沙门菌引起的腹泻，除了腹泻外，发热较为常见。病毒性腹泻症状： 病毒性腹泻一般以水样便为主，腹痛相对细菌性腹泻可能没那么剧烈，发热程度一般相对较低，多在37.5℃~38.5℃左右。像轮状病毒引起的腹泻，水样便比较典型。
治疗方式有别
细菌性腹泻治疗： 通常需要使用抗生素来治疗，比如常用的诺氟沙星等抗生素，但需要注意诺氟沙星不适合18岁以下的人群使用。一般需要根据细菌培养和药敏试验来选择合适的抗生素。病毒性腹泻治疗： 病毒性腹泻主要是对症治疗，因为目前并没有特效的抗病毒药物来直接杀灭引起腹泻的病毒。主要是纠正脱水和电解质紊乱，比如口服补液盐来补充水分和电解质，如果腹泻严重导致脱水明显可能需要静脉补液。