注射宫颈癌疫苗主要是为了预防人乳头瘤病毒（HPV）感染，从而降低患宫颈癌及癌前病变、肛门癌等疾病的风险。例如，二价宫颈癌疫苗可预防约70%的宫颈癌；四价疫苗能预防约70%的宫颈癌和90%的生殖器疣；九价疫苗能预防约90%的宫颈癌、85%的阴道癌、50%的低级宫颈病变、90%的肛门癌等。
预防宫颈癌方面的作用
针对高危型HPV： 宫颈癌主要由高危型HPV持续感染引起，像HPV16、18型等。宫颈癌疫苗能刺激机体产生抗体，抵御这些高危型HPV的感染。比如二价疫苗主要针对HPV16和18型，接种后可有效降低这两种高危型HPV引发宫颈癌的风险。降低癌前病变风险： 即使感染了HPV，在疫苗的保护下，能减少发展为高级别癌前病变的几率。研究显示，接种疫苗后，相关癌前病变的发生率明显降低。
预防其他相关疾病的作用
预防肛门癌： 九价宫颈癌疫苗对预防肛门癌也有作用，能降低由高危型HPV导致的肛门癌发病风险。因为肛门部位的癌变也与高危型HPV感染密切相关，接种疫苗可以起到防护。预防生殖器疣： 四价和九价宫颈癌疫苗还能预防生殖器疣，生殖器疣是由低危型HPV感染引起的，四价疫苗针对HPV6和11型，这两种型别是导致生殖器疣的主要亚型，接种后可降低生殖器疣的发生概率。
不同类型疫苗的差异作用
二价疫苗： 主要针对HPV16和18型，这两种型别引发宫颈癌的风险最高，能预防约70%的宫颈癌。适合9 - 45岁的女性接种。四价疫苗： 在预防HPV16、18型的基础上，还针对HPV6和11型，能预防约70%的宫颈癌和90%的生殖器疣。适合20 - 45岁的女性接种。九价疫苗： 涵盖了更多型别，除了HPV6、11、16、18型，还包括31、33、45、52、58型，能预防约90%的宫颈癌、85%的阴道癌、50%的低级宫颈病变、90%的肛门癌等。适合16 - 26岁的女性接种。