皮下脂肪瘤通常较小且无症状时无需特殊处理，若想消除主要有以下几种方式。目前并没有药物能专门消除所有皮下脂肪瘤，但对于一些特殊情况可能会用到药物辅助。比如当脂肪瘤伴有炎症时，可能会使用抗生素类药物来控制炎症，但这不是针对脂肪瘤本身的消除。
观察等待情况
一般来说，直径小于1厘米且没有任何不适症状的皮下脂肪瘤，可以选择观察等待。因为很多小的脂肪瘤生长非常缓慢，甚至可能长期稳定不变。只要定期去医院复查，观察脂肪瘤的大小、形态等有无变化就行。比如每3 - 6个月到皮肤科或者外科进行一次简单的触诊和超声检查。
手术切除情况
- 适合手术的脂肪瘤：如果皮下脂肪瘤直径大于1厘米，或者影响到美观、压迫周围组织引起不适，就可以考虑手术切除。手术切除是目前比较有效的消除皮下脂肪瘤的方法。例如脂肪瘤生长在关节部位，影响关节活动了，就需要通过手术把它切掉。
- 手术注意事项：手术前需要完善相关检查，像血常规、凝血功能等。手术后要保持伤口清洁干燥，避免感染。一般术后7 - 10天可以拆线。而且手术切除后有一定的复发概率，但相对来说对于较大或者有症状的脂肪瘤是比较直接的消除方式。
非手术的物理治疗情况
- 激光治疗：对于一些较小的皮下脂肪瘤可以考虑激光治疗。激光治疗是利用激光的热能将脂肪瘤组织破坏，从而达到消除的目的。不过激光治疗对于较大的脂肪瘤效果可能不太理想，一般适用于直径在1厘米以内的脂肪瘤。
- 冷冻治疗：冷冻治疗是通过低温使脂肪瘤组织坏死脱落。但冷冻治疗可能会引起局部疼痛、水肿等情况，而且对于位置较深或者较大的脂肪瘤效果有限，通常也是针对较小的皮下脂肪瘤尝试使用。