眼角膜上有透明小凸起，可能是病毒性结膜炎、睑裂斑、结膜淋巴管堵塞导致的，需依据具体病因进行对症治疗。
一、病毒性结膜炎：这是由腺病毒、单纯疱疹病毒等病毒感染引发的结膜急性炎症。该病症患者在发病初期通常会有结膜充血、水肿、异物感等不适表现，随着病情进展，结膜处会出现外观光滑、半透明质地的隆起样结膜改变，进而造成眼角眼白有透明凸起的现象。治疗方面，眼睛局部可遵医嘱使用抗病毒的眼药，如阿昔洛韦滴眼液、更昔洛韦滴眼液等。如果合并有细菌感染，可加用抗生素治疗，如左氧氟沙星滴眼液等。当出现严重的角膜炎引起视力下降时，可考虑使用妥布霉素地塞米松滴眼液等糖皮质激素药物。
二、睑裂斑：其具体病因目前并不明确，临床上认为与患者结膜长时间受到紫外线、阳光、粉尘等刺激有关。患者常出现眼部干涩、异物感、结膜处隆起斑块等症状，多数患者的斑块为黄色、透明的弹性组织，部分患者也会表现为眼角眼白有透明凸起。可遵医嘱给予作用较弱的激素，如氟美龙滴眼液等或抗生素药物如妥布霉素滴眼液等进行局部点眼治疗，以缓解眼部不适症状。要是出现严重影响美观、反复感染等情况，且保守治疗无效时，可以考虑手术切除睑裂斑。
三、结膜淋巴管阻塞：会表现为球结膜的泡状或串珠状局限隆起，症状明显时会引起眼部异物感、疼痛等不适。患者应遵医嘱进行抗感染治疗，比如静脉输注抗生素等，常用的药物有青霉素钠、头孢呋辛钠等。炎症缓解后，淋巴管阻塞通常会随之缓解，若症状持续加重则需要及时进行手术处理，可采用针尖穿刺法将囊状隆起穿破，使内容物流出。
总之，当发现眼角膜上有透明小凸起时，要及时明确病因，并采取相应的治疗措施。