阴茎上面长小疙瘩通常要考虑以下几种情况：
一、阴茎珍珠疹：这一般是因生理发育变异引发的丘疹，其颜色可为白色、肤色或淡红色，通常不会有疼痛和瘙痒感，属于良性皮肤病变。当患者出现这种状况时，通常无需特殊治疗。
二、包皮龟头炎：这是由多种因素导致的包皮和龟头黏膜的炎症性疾病。患者往往会有局部红斑、糜烂和出血表现，严重时还会形成水疱，且伴有大量豆腐渣样白色分泌物。在治疗上，患者一般可使用红霉素软膏、硝酸咪康唑软膏等药物进行局部涂抹，症状通常会得以改善。
三、尖锐湿疣：它是由人乳头瘤病毒感染引起，以肛门生殖器部位增生性损害为主要表现的性传播疾病。患者常会在局部出现鸡冠样或菜花样丘疹，其表面角化过度，比较粗糙，触摸时会有疼痛感。在治疗方面，通常是以抗病毒药物为主，常用的有伐昔洛韦、阿昔洛韦等。
总之，当阴茎上出现小疙瘩时，应根据具体表现来判断可能的疾病，并采取相应的治疗措施。如果自己无法准确判断或症状持续不缓解，应及时就医，以便明确诊断和进行规范治疗。