灭活疫苗是将病毒或细菌培养后，用物理或化学方法将其灭活，使其失去感染性和复制力，但保留免疫原性。减毒疫苗是通过对病毒或细菌进行处理，使其毒力减弱，但仍保持免疫原性和繁殖能力。
一、制备工艺不同
灭活疫苗需通过物理或化学手段破坏病原体的活性，使其不再具有致病性，但保留抗原成分；减毒疫苗是让病原体的毒力降低，仍能在体内有一定程度的复制。
二、免疫效果差异
减毒疫苗免疫效果通常较强且持久，因为它能在体内模拟轻微感染过程，激发机体产生较强的细胞免疫和体液免疫；灭活疫苗免疫效果相对较弱，可能需要多次接种来增强免疫应答。
三、安全性有别
减毒疫苗存在潜在的回复毒力风险，即弱毒病原体可能恢复致病性，尤其是对于免疫功能低下人群；灭活疫苗安全性相对较高，因为病原体已被完全灭活，一般不会导致感染发病。
四、储存运输要求
减毒疫苗通常需要在冷链条件下储存运输，以保持疫苗的活性；灭活疫苗对储存运输条件的要求相对宽松一些，但也需在规定温度范围内保存。特殊人群方面，免疫功能低下者接种减毒疫苗需谨慎，因为存在回复毒力引发感染的风险；而灭活疫苗相对更适合这类人群，但也需遵循专业医生的建议来决定是否接种及接种方案。