十二指肠溃疡的最佳治疗方法通常包括药物治疗、生活方式调整等方面。一般来说，药物治疗是关键，常用的药物有抑制胃酸分泌的药物等。
药物治疗方面
抑制胃酸分泌药物： 质子泵抑制剂是常用的一类，像奥美拉唑等，它能有效抑制胃酸分泌，为溃疡愈合创造良好的酸性环境。H₂受体拮抗剂也是可选药物，比如雷尼替丁，也可以起到减少胃酸分泌的作用。根除幽门螺杆菌治疗： 如果十二指肠溃疡是由幽门螺杆菌感染引起的，就需要进行根除幽门螺杆菌的治疗。通常采用联合用药的方式，比如质子泵抑制剂加上两种抗生素，再加上铋剂，一般需要连续用药10 - 14天左右来彻底根除幽门螺杆菌。
生活方式调整方面
饮食调整： 要规律饮食，定时定量进食，避免暴饮暴食。尽量少吃辛辣、油腻、刺激性食物，比如辣椒、油炸食品等，这些食物会刺激胃酸分泌，加重溃疡症状。同时，要避免饮用咖啡、浓茶等，因为其中的咖啡因等成分也可能刺激胃酸分泌。作息规律： 保证充足的睡眠，避免过度劳累和精神紧张。长期的精神紧张会影响胃酸分泌的调节，不利于溃疡的愈合。保持良好的心态，适当进行一些舒缓的运动，如散步等，有助于身体的恢复。
手术治疗情况
手术指征： 一般来说，十二指肠溃疡通过药物等保守治疗大多能取得较好效果，但如果出现严重并发症，如大量出血经药物等保守治疗无法止血、穿孔、幽门梗阻经反复呕吐等情况时，就可能需要考虑手术治疗。不过这种情况相对较少见，大多数患者通过规范的内科治疗即可治愈。