治角膜炎常用的眼药水类型较多，具体使用需根据角膜炎的类型来定。一般来说，细菌性角膜炎常使用抗生素类眼药水，如氧氟沙星滴眼液，它能抑制细菌DNA旋转酶，从而阻碍细菌DNA复制，起到杀菌作用；妥布霉素滴眼液也是常用的针对细菌感染的抗生素眼药水，对多种革兰氏阴性及阳性细菌有抗菌活性。
细菌性角膜炎用的眼药水
氧氟沙星滴眼液： 主要针对敏感菌引起的细菌性结膜炎、角膜炎等。一般来说，点眼时每次1-2滴，每天3-5次。需要注意的是，对氧氟沙星或喹诺酮类药物过敏者禁用。妥布霉素滴眼液： 适用于由敏感细菌引起的外眼及附属器的局部感染。使用时通常每4-6小时点眼1次，每次1-2滴。不过，使用过程中可能会出现局部的刺激症状，如眼睑灼痛、肿胀等，若出现严重不适需及时停药就医。
病毒性角膜炎用的眼药水
更昔洛韦滴眼液： 用于治疗单纯疱疹病毒性角膜炎。滴入眼睑内，一次1-2滴，每2小时1次，一日给药7-8次。孕妇及哺乳期妇女慎用，对更昔洛韦过敏者禁用。阿昔洛韦滴眼液： 对单纯疱疹病毒、水痘-带状疱疹病毒有抑制作用。用法一般是每1-2小时滴眼1次，每次1-2滴。使用时可能会出现眼部轻度疼痛和烧灼感等不良反应，若症状明显应停药。
真菌性角膜炎用的眼药水
那他霉素滴眼液： 是一种抗真菌药，适用于对那他霉素敏感的微生物引起的真菌性睑炎、角膜炎。使用时需将那他霉素滴眼液滴入结膜囊内，每次1-2滴，每1-2小时1次，治疗一般要持续14-21天或直到活动性真菌性角膜炎消退。不过，使用该药物可能会出现过敏反应等，用药过程中需密切观察。氟康唑滴眼液： 主要用于治疗白色念珠菌、烟曲霉菌、克柔念珠菌、新型隐球菌等引起的真菌性角膜炎。一般用法是一次1-2滴，每15-30分钟滴眼1次，病情控制后逐渐减少滴眼次数。但该药物也可能引起眼部刺激症状，如灼烧感、刺痛等。