月经第六天有褐色分泌物可能的原因包括正常现象、阴道炎、子宫息肉等，具体如下。
一、正常现象：女性月经通常持续三到七天，若第六天仍有褐色分泌物，且无其他不适症状，一般是正常的，表明月经期尚未结束，无需特殊处理，做好局部清洁卫生即可。
二、阴道炎：
1.可能由不良卫生习惯、病原体感染等引起。
2.会导致经期出现异常褐色分泌物，同时往往伴有酸臭味、阴道瘙痒等症状。
3.患者可在医生指导下使用红核妇洁洗液、硝酸咪康唑栓等药物进行治疗。
三、子宫息肉：
1.一般由内分泌失调、炎症刺激等导致。
2.可引起阴道出血、白带异常等，还会使经血淋漓不尽。
3.患者可在医生指导下通过子宫内膜息肉切除术进行治疗，术后要注意局部卫生，避免食用辣椒、芥末等辛辣刺激食物。
除以上常见原因外，还有可能是如子宫肌瘤等其他原因引起，建议及时就医诊断。