扁桃体发炎晚上咳嗽厉害的应对措施包括：饮食疗法、局部治疗、对症支持治疗。
一、饮食疗法
饮食上应选择易于消化且营养丰富的流质或半流质食物，像稀粥、软面条、蔬菜汁、果汁等。同时要尽量避免食用辛辣刺激性强的食物，如火锅、酒、烧烤等，以免加重咽喉部疼痛。
二、局部治疗
1.可以采用生理盐水含漱，并且含服西地碘含片、西瓜霜含片等，来缓解咽喉部疼痛。
2.如果是细菌感染引发的扁桃体发炎咳嗽，则需要使用抗菌素进行抗感染治疗，可以口服青霉素类药物，常见的有阿莫西林、阿莫西林克拉维酸钾等，也可口服头孢菌素类药物，如头孢克洛、头孢呋辛等。当痰量过多或有脓痰时，可给予祛痰药物，比如氨溴索，还可进行气道雾化治疗以促进排痰。
三、对症支持治疗
在咽痛咳嗽剧烈或高热时，可口服退热药及镇痛药，以帮助缓解不适，如口服对乙酰氨基酚或者布洛芬。
总之，如果扁桃体发炎晚上咳嗽症状较为严重，建议及时到医院完善相关检查，并接受专业的诊治。