奥氮平最严重的副作用之一是代谢方面的问题，比如可能导致体重显著增加，有研究显示部分患者使用奥氮平治疗后，体重在数月内可增加5%以上。
代谢相关副作用：
血糖异常风险： 奥氮平可能会影响胰岛素的作用，增加糖尿病的发生风险。使用奥氮平的患者中，有一定比例会出现血糖升高的情况，需要定期监测血糖水平。血脂异常： 它还可能引起血脂紊乱，使患者体内的胆固醇、甘油三酯等指标出现异常，增加心血管疾病的潜在风险。
神经系统相关副作用：
嗜睡与镇静： 服用奥氮平后，很多患者会出现明显的嗜睡症状，这会影响日常生活和工作效率，严重时甚至可能导致患者在活动时出现意外，比如驾车时因嗜睡发生危险。锥体外系反应： 虽然相对其他一些抗精神病药物发生率不是特别高，但也有少数患者会出现震颤、肌张力增高、运动迟缓等锥体外系反应，影响身体的运动协调性。
心血管系统相关副作用：
心电图改变： 部分患者使用奥氮平后可能出现心电图异常，如QT间期延长等情况，虽然不一定都会引发严重后果，但需要密切关注心脏电生理情况，尤其是有心脏基础疾病的患者使用时更要谨慎。低血压风险： 可能导致体位性低血压，患者从卧位突然站起时，血压会明显下降，出现头晕、眼前发黑等症状，增加跌倒的可能性。