三个月不来月经可通过检查、药物、手术等方式予以治疗。具体如下：
一、检查：
1.若同房时未做好避孕措施而致怀孕，便可能出现月经不来现象，可前往医院进行抽血HCG和B超检查，以判断是否怀孕。
二、药物：
1.倘若三个月不来月经是因内分泌紊乱，还可在医生指导下服用调经药物进行治疗，例如地屈孕酮片。
三、手术：
1.要是受到物理化学损伤或感染，使得子宫颈黏膜发生粘连，造成子宫颈管狭窄或闭锁，也有很大概率会导致月经不来，此时需要遵循医嘱及时采取宫颈扩张术或宫颈粘连分离术等方式进行处理。
三个月不来月经若伴有其他不适症状，还需到医院排除肺结核、肿瘤、甲状腺功能减退等疾病的可能性。总之，当出现三个月不来月经的情况时，应根据具体情况选择合适的方法进行诊断和治疗，同时要关注是否有其他相关症状，以便更全面地进行诊治。