怀孕时真菌感染是否会影响胎儿取决于感染部位。若为阴道真菌感染，如外阴阴道假丝酵母菌病，则可能影响胎儿；若为其他部位真菌感染，如皮肤或口腔，通常不会影响胎儿。
一、阴道真菌感染：
怀孕时因机体激素水平变化，阴道局部细胞免疫能力下降，使得阴道中的真菌假丝酵母菌大量繁殖，引发阴道真菌感染。孕妇主要表现为外阴阴道瘙痒，阴道分泌物增多，其中阴道瘙痒症状较为明显且持续时间长，严重者会坐立难安，部分孕妇还可能有外阴部灼热痛及排尿痛，阴道分泌物的特点为白色稠厚、呈豆腐渣样。若孕妇出现阴道真菌感染，特别是在怀孕初期，可能会影响到胎儿，反复的真菌感染可能导致胎儿宫腔内感染，危及胎儿生命健康，易引发胎膜早破、绒毛膜羊膜炎等情况。
二、其他部位的真菌感染：
若孕妇出现皮肤或口腔的真菌感染，其表现可能为皮肤瘙痒、干裂、出现红斑等，或者口腔黏膜有白斑、疼痛、吞咽困难等，这种感染一般不会进入宫腔，也不会随胎盘循环进入胎儿体内，通常不会对胎儿造成影响。
如果孕妇发生真菌感染，一定要及时到医院就诊，切不可自己盲目用药。要是阴道出现真菌感染，在怀孕前3个月，孕妇不可随意用药，可多食用新鲜蔬菜、水果，保证鸡蛋、牛奶、瘦肉等优质蛋白的摄入，这在一定程度上能抑制体内真菌繁殖，维护孕妇健康。
总之，怀孕时真菌感染对胎儿的影响因感染部位而异，孕妇一旦发现感染应尽快就医，遵循医生建议进行处理。