儿童反复发烧的原因有多种，比如感染性因素，像病毒感染较为常见，有数据显示儿童上呼吸道感染中约60% - 70%是由病毒引起的，常见的有流感病毒、鼻病毒等；细菌感染也会导致反复发烧，像肺炎链球菌、B族链球菌等都可能引发。非感染性因素也不少见，比如自身免疫性疾病，幼年特发性关节炎就是儿童时期常见的自身免疫性疾病，会出现反复发热的情况，还可能伴有关节肿胀、疼痛等症状；还有川崎病，这是一种以全身血管炎为主要病变的急性发热出疹性小儿疾病，发热时间通常持续5天以上，还会伴有球结膜充血、口唇皲裂等表现。
感染性因素导致反复发烧
病毒感染：多种病毒可引起儿童反复发烧，像流感病毒引起的流感，除了反复发热外，还常伴有头痛、肌肉酸痛、乏力等症状；鼻病毒引起的普通感冒，一般发热程度相对较轻，但也会反复，同时有鼻塞、流涕等症状。细菌感染：肺炎链球菌感染可能引发肺炎，除了反复发热，还会有咳嗽、咳痰、呼吸急促等表现；B族链球菌感染在新生儿中较为常见，会出现发热、拒奶、嗜睡等症状。
非感染性因素导致反复发烧
自身免疫性疾病：幼年特发性关节炎除了反复发热外，关节症状是重要表现，小年龄儿童多为全身型，可出现皮疹、肝脾淋巴结肿大等；较大儿童多为少关节型或多关节型，关节症状会更明显。川崎病：除了长时间发热外，还会有手足硬性水肿、恢复期指（趾）端膜状脱皮、杨梅舌等典型表现，需要及时就医诊断治疗，因为不及时治疗可能会影响心血管系统。