灰指甲主要由皮肤癣菌等真菌感染引起，治疗方法有外用药物、口服药物及手术拔甲等。一般来说，外用抗真菌药疗程较长，可能需要数月，而口服抗真菌药相对见效快些，但要注意药物的肝毒性等问题。
外用药物治疗
局部涂抹抗真菌药膏：像阿莫罗芬搽剂就比较常用，它能渗透进甲板发挥抗真菌作用。每周使用1 - 2次，连续使用几个月，不过要坚持使用才能看到效果。注意事项：使用前要先把病甲尽量修薄，这样药物能更好地渗透，但修甲时要小心别伤到周围正常皮肤。
口服抗真菌药物
常用口服药：伊曲康唑是常见的口服抗真菌药，它采用冲击疗法，也就是吃一周停三周为一个疗程，一般需要几个疗程。还有特比萘芬，每天服用一次，连续服用几个月。特殊人群提示：这类口服药可能会对肝脏有影响，所以在服药前需要检查肝功能，有肝脏疾病的人要谨慎使用，而且孕妇、哺乳期女性一般不建议使用。
手术拔甲治疗
手术拔甲情况：如果只有少数病甲，或者外用和口服药物治疗效果不好时，可以考虑手术拔甲。不过手术拔甲创伤比较大，术后恢复需要一定时间，而且拔甲后还要配合抗真菌药物治疗，防止新长出来的指甲再次被感染。术后护理：拔甲后要保持伤口清洁，避免沾水，防止感染，同时按照医生要求使用抗真菌药物预防复发。
日常预防与护理
个人卫生方面：要保持手足清洁干燥，勤换鞋袜，尽量穿透气的鞋子。不和他人共用拖鞋、脚盆、指甲刀等生活用品，避免交叉感染。生活习惯：如果有脚气等其他部位的真菌感染要及时治疗，因为脚气可能会传染到指甲引起灰指甲。另外，还要注意增强自身免疫力，比如合理饮食、适量运动等，免疫力低下也容易引发灰指甲。