掌跖脓疱病的治疗需综合多种方法，一般可通过局部治疗、系统治疗等方式来改善。局部治疗中，糖皮质激素药膏是常用的，比如强效的卤米松乳膏等，能起到抗炎的作用，缓解局部的脓疱、红斑等症状，但要注意长期使用可能会有皮肤萎缩等副作用，使用时间一般不超过2 - 3周。
局部治疗方法
外用糖皮质激素： 像糠酸莫米松乳膏，适用于轻度的掌跖脓疱病患者，能减轻炎症反应，缓解瘙痒和脓疱情况，但连续使用不宜超过4周。他扎罗汀凝胶： 属于维A酸类药物，可调节表皮细胞的增殖和分化，对掌跖脓疱病也有一定疗效，但使用后可能会有局部刺激症状，如红斑、脱屑等，使用时要避免接触正常皮肤。
系统治疗药物
免疫抑制剂： 甲氨蝶呤是常用的免疫抑制剂，可抑制细胞增殖，控制病情发展，但甲氨蝶呤有肝毒性等副作用，使用期间需要定期监测肝功能，一般每周服用一次，每次剂量需根据患者具体情况由医生调整。阿维A胶囊： 能调节表皮细胞分化和增殖，对掌跖脓疱病有较好的效果，但孕妇禁用，且服用后可能会出现皮肤干燥、口唇干裂等不良反应，服药期间要注意保湿。
物理治疗方式
紫外线照射： 窄谱中波紫外线（NB - UVB）治疗是常用的物理方法，一般需要多次治疗，每周2 - 3次，通过紫外线的作用来抑制皮肤细胞的过度增殖和炎症反应，对掌跖脓疱病有一定的疗效，但治疗过程中要注意保护正常皮肤，避免过度照射导致损伤。PUVA治疗： 即补骨脂素联合长波紫外线照射，也可用于掌跖脓疱病的治疗，但需要先口服补骨脂素，然后再进行紫外线照射，使用过程中要注意光敏反应等副作用，并且要严格掌握照射剂量。