新生儿父亲有乙肝时，新生儿乙肝疫苗第二针一般可以推迟1~2个月，但尽量不要超过3个月。
推迟的时间范围依据
乙肝疫苗接种程序通常是出生时第一针，1个月后第二针，6个月后第三针。如果父亲有乙肝，新生儿接种第二针疫苗一般可以适当推迟，但最好在1~2个月内完成，尽量不要超过3个月。因为乙肝疫苗接种需要按照一定的时间间隔来刺激机体产生足够的抗体，如果推迟过久可能会影响免疫效果。
推迟期间的注意事项
接种前的观察：在推迟接种第二针乙肝疫苗期间，要注意观察新生儿的身体状况。如果新生儿出现发热（体温超过37.5℃）、腹泻、严重湿疹等情况，需要暂缓接种，等身体恢复健康后再考虑接种时间。
与医生沟通：家长要及时和儿科医生沟通，让医生了解新生儿的具体情况以及乙肝疫苗推迟的情况，医生会根据新生儿的综合状况给出进一步的建议。比如医生可能会根据新生儿的实际情况调整后续接种第三针的时间等。
推迟对免疫效果的影响
虽然适当推迟乙肝疫苗第二针一般不会完全失去免疫效果，但可能会使抗体产生的时间延长或者抗体滴度相对较低。所以一旦新生儿身体状况允许，应尽快安排接种第二针乙肝疫苗。如果推迟时间过长，可能需要重新评估接种方案，但这种情况相对较少见，只要在合理的推迟范围内，一般通过后续规范接种仍能获得较好的免疫保护。总之，新生儿父亲有乙肝时，乙肝疫苗第二针可以适当推迟，但要在合理的时间范围内，并且注意推迟期间的相关情况，及时与医生沟通以保障新生儿能获得良好的乙肝免疫防护。