检查肛门可根据具体情况选择挂皮肤科、肛肠外科、普通外科、肿瘤科、消化内科等科室。具体如下：
一、皮肤科：若为肛周湿疹、肛周毛囊炎等疾病引发的肛门瘙痒，应前往正规医院皮肤科就诊。肛周湿疹是一种发生在肛门周围皮肤的非传染性变态反应性疾病，可出现多形性皮疹，有渗出倾向，瘙痒剧烈等症状；肛周毛囊炎则多由细菌感染引起，主要表现为毛囊周围的红肿、疼痛、脓疱等。
二、肛肠外科：若是痔疮或肛裂导致，且伴有局部疼痛、便血等情况，建议去医院的肛肠外科。痔疮是常见的肛肠疾病，可分为内痔、外痔和混合痔，主要症状有便血、痔核脱出、疼痛等；肛裂则是齿状线下肛管皮肤层裂伤后形成的小溃疡，典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。
三、普通外科：对于肛周脓肿引起的肛周不适，可选择到医院普通外科。肛周脓肿是发生于肛门、肛管和直肠周围的急性化脓感染性疾病，会有肛周持续性剧痛、红肿等症状。
四、肿瘤科：如果是肛门周围癌所引起，同时伴有疼痛、瘙痒、便血等情况，要前往医院的肿瘤科。肛门周围癌是指发生在肛门周围的恶性肿瘤，早期症状可能不明显，随着病情发展会出现上述症状以及肛门肿块等。
五、消化内科：倘若患者伴有消化不良，且出现恶心、呕吐、腹胀等情况，建议到医院的消化内科。消化不良可由多种原因引起，可导致胃肠功能紊乱，出现一系列消化道症状。
由于引起肛门不适的病因各异，且治疗方法也不同，所以建议及时到医院，配合医生采取合理的治疗方式，以免影响治疗效果。