遗精通常发生在夜间睡眠时，如果晚上遗精时会感到疼痛，可能是由前列腺炎、精囊炎、龟头炎等疾病引起的，这是因为炎症导致局部黏膜破损，从而在遗精时因精液刺激而产生疼痛，可以前往医院男科或泌尿外科进行精液分析、B超等检查来确诊。
一、前列腺炎：
1.主要是病原体感染所致，患者容易出现机体乏力、腹部胀痛、尿频、尿急等症状，还可能有脓性分泌物从尿道流出，会出现晚上遗精疼痛的现象。
2.建议患者在医生指导下使用盐酸莫西沙星片、左氧氟沙星胶囊等药物进行治疗，同时要保持尿道口清洁。
二、精囊炎：
1.主要是由致病菌感染造成，常见致病菌包括变形杆菌、大肠杆菌等，患病后会有尿痛、排尿不畅、血精、射精疼痛等表现，进而导致晚上遗精疼痛，还会影响正常生活，出现性欲低下的情况。
2.建议患者在医生指导下使用盐酸多西环素肠溶胶囊、盐酸米诺环素胶囊等药物治疗，遗精后要及时清洗龟头皮肤，穿着棉质宽松内裤。
三、龟头炎：
1.一般是由感染以及外伤等病因引发的一种炎症，会导致局部皮肤发红、肿胀、糜烂、溃疡等症状，当局部皮肤溃烂时，由于精液刺激，晚上遗精会疼痛。
2.建议患者在医生指导下使用罗红霉素分散片口服来抗菌消炎，或者使用复方酮康唑乳膏进行局部涂抹。
四、尿道炎症：
1.由于淋病双球菌感染以及非淋病双球菌感染造成，会出现尿道刺痒、排尿次数增多、血尿等情况，且在发病期间淋球菌会通过尿道进入体内刺激睾丸部位，导致晚上遗精疼痛。
2.建议患者在医生指导下使用头孢呋辛酯片、头孢克肟分散片等。
总之，如果出现晚上遗精疼痛的情况，应及时就医检查和治疗，明确具体病因后采取针对性的治疗措施。