来完月经后小肚子疼通常由以下原因引起：
一、盆腔炎：因感染沙眼衣原体、淋球菌等病原体而引发盆腔炎。在临床上一般会有下腹疼痛的表现，有时就会呈现出来完月经后小肚子疼的状况。患者可在医生指导下进行服药治疗，如阿莫西林胶囊、阿奇霉素等。其治疗原理是通过药物的抗菌作用来消除炎症。
二、子宫内膜异位症：该病症常表现为继发性痛经，或会出现来完月经后小肚子疼的情形。多数情况下可考虑用妇女痛经丸、痛经宝颗粒等药物进行治疗，然而若药物治疗无效，则需考虑手术治疗。这是因为这些药物能够在一定程度上缓解疼痛和调节激素水平，而手术则是对于严重且药物无法控制的情况的一种有效解决方式。
三、宫颈炎：宫颈炎也可能导致来完月经后小肚子疼的症状，主要是由于患者宫颈部位持续受到细菌刺激，使得局部黏膜受到刺激而引起。患者可在医生的指导下使用药物进行治疗，比如阿奇霉素片等，同时患者在患病期间应注重局部卫生，以避免出现不良的反应。通过使用特定药物可以起到抗菌消炎的作用，从而减轻症状。
总之，来完月经后小肚子疼可能是多种妇科疾病导致的，需要及时就医，明确病因后进行针对性的治疗。同时，在治疗过程中要注意相关的注意事项，以促进身体的恢复。