疟疾通常会有典型的周期性发作症状，一般间隔数小时到数天不等。比如间日疟和卵形疟常间隔48小时发作一次，三日疟间隔72小时发作一次。
典型症状表现
寒战期：患者会突然感觉很冷，接着身体开始发抖，牙齿打战，面色苍白，皮肤起鸡皮疙瘩，这个过程一般持续10分钟到2小时左右。此时体温会迅速上升，可高达39℃甚至更高。发热期：寒战之后体温快速上升，进入高热阶段，患者会觉得燥热，皮肤滚烫，头痛、全身酸痛等症状明显，持续时间大概2 - 6小时。出汗期：高热之后，患者开始大量出汗，体温迅速下降，可恢复到正常或正常以下水平，这个过程持续1 - 2小时。之后患者可能会感觉疲劳，但精神会逐渐好转。
伴随症状情况
消化系统症状：部分患者会出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状。比如有些患者在疟疾发作时，胃肠道功能受到影响，就会有不想吃东西、肚子不舒服拉肚子的情况。神经系统症状：严重的疟疾可能会引起头痛、头晕、烦躁不安，甚至出现意识障碍等。像脑型疟疾患者就可能有嗜睡、昏迷等表现，这是因为疟原虫侵犯了脑部组织。其他症状：还可能有乏力、肌肉酸痛、贫血等表现。由于疟原虫破坏红细胞，患者会出现不同程度的贫血，表现为面色萎黄、活动后气短等。
不同人群症状差异
儿童患者：儿童患疟疾时症状往往更不典型，可能除了发热外，还容易出现惊厥。有的儿童会精神萎靡、哭闹不安，而且病情变化比较快，需要密切观察。比如2岁以下的儿童感染疟疾后，可能很快就会出现高热惊厥的情况，家长要特别留意。孕妇患者：孕妇患疟疾风险更高，除了常见的寒战、发热、出汗等症状外，更容易出现贫血、流产、早产等情况。因为孕妇身体处于特殊状态，疟疾对母婴健康影响较大。老年人患者：老年人免疫力相对较低，患疟疾后症状可能不典型，发热可能不明显，但更容易出现意识障碍、呼吸循环衰竭等严重情况，预后相对较差。
特殊类型疟疾症状
凶险型疟疾：包括脑型疟疾、超高热型疟疾等。脑型疟疾主要表现为剧烈头痛、烦躁不安、抽搐、昏迷等；超高热型疟疾则是体温迅速升高到41℃以上，病情进展非常快，如果不及时救治，会有生命危险。输血后疟疾：是由于输入了含有疟原虫的血液而感染，一般在输血后7 - 10天发病，症状与蚊传疟疾相似，但没有潜伏期，直接进入发作期，症状可能比较急重。