治疗乙肝并没有绝对最好的药，目前常用的抗病毒药物有恩替卡韦、替诺福韦等。一般来说，恩替卡韦能强效抑制乙肝病毒复制，口服吸收好，每天一次用药。替诺福韦也是常用药物，对乙肝病毒的抑制作用持久。
核苷（酸）类似物
恩替卡韦： 属于强效抑制乙肝病毒复制的药物，它能快速降低乙肝病毒DNA水平，长期使用耐药发生率低。但需要长期服用，不能随意停药。替诺福韦： 抗病毒作用较强，对拉米夫定耐药的患者也有效，安全性相对较好，不过肾功能不全患者需要调整剂量。
干扰素类药物
普通干扰素： 需每周皮下注射3次，疗程相对固定，一般为1年左右。它不仅能抗病毒，还能调节机体免疫，但可能会引起流感样症状等不良反应，如发热、头痛、肌肉酸痛等。聚乙二醇干扰素： 每周注射一次，相比普通干扰素，用药更方便，抗病毒疗效也有一定优势，不过同样可能出现流感样症状等副作用。
乙肝治疗的注意事项
用药依从性： 无论是核苷（酸）类似物还是干扰素，都需要患者严格遵循医嘱用药。比如核苷（酸）类似物一旦开始服用，就不能随便漏服或停药，否则可能导致病毒反弹，甚至病情加重。定期监测： 在治疗过程中要定期检查乙肝五项、乙肝病毒DNA定量、肝功能等指标。一般每3 - 6个月要复查一次，通过这些检查来评估治疗效果和药物的安全性。例如，通过乙肝病毒DNA定量可以了解病毒复制被抑制的情况，通过肝功能检查能知道肝脏的损伤程度等。特殊人群用药： 对于孕妇等特殊人群，用药需要格外谨慎。孕妇使用抗乙肝病毒药物可能会对胎儿产生影响，必须在医生的充分评估下，权衡利弊后选择合适的治疗方案。