肠上皮化生的治疗和控制方式包括药物治疗控制、病因治疗控制以及其他治疗控制。具体如下：
一、药物治疗控制：
1.胃黏膜保护剂：如替普瑞酮，能够降低对肠道的损伤。
2.辅助治疗药物：像胃复春、摩罗丹等，可起到辅助作用。
二、病因治疗控制：
胃肠上皮化生主要由慢性胃炎引起，而慢性胃炎多因幽门螺杆菌感染所致，所以需要进行四联药物治疗，常见药物有奥美拉唑、枸橼酸铋钾、阿莫西林、左氧氟沙星等。同时，日常要注意饮食等方面，防止病状加重。
三、其他治疗控制：
日常饮食应多选择清淡且容易消化的食物，减少辛辣刺激食物的摄入，油腻食物也尽量少吃，要多食用新鲜的水果和蔬菜。
注意事项：患者在日常生活中若有任何不适，必须及时到医院就诊。
总结：对于肠上皮化生，要通过多种方式进行治疗和控制，包括使用特定药物、针对病因治疗以及注意日常饮食等，且患者有不适时要及时就医。