新生儿大便有酸味主要由以下原因引起：
1.正常现象：新生儿的肠道内有正常菌群，这些菌群会使食物发酵，产生酸味。此外，新生儿的消化系统尚未完全发育成熟，对脂肪和蛋白质的消化能力有限，也会导致大便有酸味。通常情况下，这种酸味是正常的，不会对新生儿的健康造成影响。
2.消化不良：如果新生儿摄入的食物过多或过快，或者消化系统出现问题，就可能导致消化不良，使大便有酸味。此外，如果新生儿吃了含有过多乳糖或蛋白质的食物，也可能引起消化不良。
3.感染：某些细菌、病毒或其他感染源也可能导致新生儿大便有酸味。这些感染可能会引起肠道炎症或其他问题，从而导致大便异常。
4.过敏：如果新生儿对某些食物或物质过敏，也可能导致大便有酸味。过敏可能会引起肠道炎症或其他问题，从而导致大便异常。
5.其他：如果新生儿的饮食中含有过多的糖分或人工甜味剂，也可能导致大便有酸味。此外，某些药物或医疗条件也可能导致大便有酸味。
需要注意的是，如果新生儿的大便有明显的异味、颜色异常、质地异常或伴有其他症状，如腹泻、呕吐、发热等，应及时就医。医生会根据具体情况进行诊断和治疗。