重症肌无力的治疗需要综合多方面措施。一般来说，药物治疗是重要手段之一，比如胆碱酯酶抑制剂是常用药物，能暂时改善肌无力症状。
药物治疗方面
胆碱酯酶抑制剂： 这类药物可以通过抑制胆碱酯酶的活性，增加突触间隙乙酰胆碱的浓度，从而改善肌无力症状。常用的有溴吡斯的明等，它能在一定程度上缓解患者眼睑下垂、复视等症状。免疫抑制剂： 包括糖皮质激素，如泼尼松等，它可以调节免疫系统，减少自身抗体对神经肌肉接头的攻击。还有如硫唑嘌呤等药物，也能起到抑制免疫反应的作用，帮助控制病情发展。
胸腺相关治疗
胸腺切除手术： 约70%的重症肌无力患者伴有胸腺增生，10% - 15%的患者伴有胸腺瘤。对于伴有胸腺增生或胸腺瘤的患者，胸腺切除手术是重要的治疗方法。一般来说，手术时机的选择需要综合评估患者病情，多数患者在手术后症状会有所改善，部分患者甚至可以达到临床缓解。
血浆置换疗法
血浆置换： 这种方法是通过将患者的血浆去除，置换为正常血浆，从而清除血浆中的自身抗体等有害物质。通常适用于病情严重、处于危象状态的患者，或者是在手术前需要快速改善症状的患者。一般一次血浆置换能在短期内改善症状，但需要根据患者情况多次进行。
静脉注射免疫球蛋白
静脉注射免疫球蛋白： 它可以调节免疫功能，阻断自身抗体的作用。适用于重症肌无力危象、不宜用糖皮质激素治疗的患者等。一般每次静脉注射免疫球蛋白需要一定的剂量和疗程，能在一定时间内缓解患者的肌无力症状。