婴儿乳糖不耐受主要表现为消化道相关症状。一般来说，婴儿乳糖不耐受时，最常见的表现是腹泻，每天可能会拉数次甚至十几次，大便多为黄色或青绿色稀糊便，或呈蛋花汤样，泡沫多，有奶块。
消化道症状表现
腹泻情况： 婴儿乳糖不耐受引发的腹泻，大便次数相对较多，有的宝宝一天腹泻5 - 10次不等，大便性状较稀，可能伴有奶瓣。腹胀表现： 还会出现腹胀的情况，宝宝的小肚子看起来鼓鼓的，有的宝宝会因为腹胀而哭闹不安。
其他伴随症状
吐奶现象： 部分婴儿乳糖不耐受时会有吐奶的情况，吐奶量多少不一，可能是轻微吐出几口奶，也可能吐出较多。哭闹不安： 由于身体不适，婴儿会频繁哭闹，难以安抚，这是因为肚子不舒服，如腹胀、腹痛等导致的。
不同类型的表现差异
原发性乳糖不耐受： 多在婴儿出生后不久就出现症状，从婴儿开始进食母乳或普通配方奶后就会逐渐表现出上述消化道及其他不适症状。继发性乳糖不耐受： 往往是在婴儿患某些疾病后出现，比如婴儿感染轮状病毒等引起胃肠功能紊乱时，原本能消化乳糖的能力受到影响，从而出现乳糖不耐受的表现，一般在原发病后出现相关症状。