阴茎旁边部分疼痛可能由多种原因引起。比如包皮龟头炎，这是比较常见的原因之一。一般来说，包皮过长或者个人卫生清洁不到位容易引发，患者可能会感觉阴茎旁边局部红肿、疼痛，严重时可能有分泌物。
炎症感染因素
包皮龟头炎：除了上述情况，还可能是细菌、真菌等感染导致。如果是细菌感染，局部可能有脓性分泌物；若是真菌感染，可能会有局部瘙痒、红斑等表现。尿道炎累及：尿道炎也可能牵连到阴茎旁边部位引起疼痛。尿道炎通常是病菌感染尿道所致，患者可能伴有尿频、尿急、尿道分泌物等症状，炎症蔓延可能波及阴茎旁边区域。
外伤因素
外力碰撞：比如性生活中过于剧烈的动作、日常活动中不小心碰撞到阴茎旁边部位，都可能导致局部疼痛，可能会有明显的外伤痕迹，像淤血、肿胀等情况。过度摩擦：长时间走路、骑车等导致阴茎旁边部位过度摩擦，也会引起疼痛，一般会有局部皮肤的不适表现，比如发红等。
结石相关因素
尿道结石：尿道结石也可能引发阴茎旁边部分疼痛。尿道结石通常是肾脏或膀胱的结石排到尿道中导致，患者可能有排尿困难、点滴状排尿等表现，同时阴茎旁边部位可能会有牵涉痛。阴囊结石：虽然相对少见，但阴囊内的结石也可能引起阴茎旁边区域的疼痛，可能会有局部的硬结等表现。