碱性磷酸酶高的治疗需先明确病因，不同病因治疗方式不同。比如骨骼疾病引起的碱性磷酸酶高，若为青少年生长痛导致，一般无需特殊用药，通过适当休息等可能缓解；若为骨肿瘤等疾病引起，则可能需要进一步的手术等治疗。
病因不同治疗有别
肝胆疾病相关治疗
如果是肝炎引起碱性磷酸酶高，急性肝炎患者需注意休息，一般经过1 - 3个月左右的休养，部分患者肝功能可逐渐恢复正常。若是肝硬化导致碱性磷酸酶高，要针对肝硬化进行综合治疗，包括保护肝细胞、抗纤维化等治疗，必要时可能需要进行肝移植评估等。
骨骼疾病相关治疗
对于佝偻病导致的碱性磷酸酶高，儿童患者需要补充维生素D，一般每天补充维生素D的剂量需根据具体情况而定，同时要保证充足的阳光照射，促进钙的吸收，通常经过规范补充维生素D等治疗，几个月后碱性磷酸酶水平可能逐渐下降。而对于骨恶性肿瘤引起的碱性磷酸酶高，往往需要采取手术、化疗等综合治疗手段。
其他情况相关治疗
如果是妊娠期间出现碱性磷酸酶高，这是一种生理现象，一般不需要特殊降酶治疗，待分娩后，碱性磷酸酶水平通常会逐渐恢复正常。而对于甲状腺功能亢进引起的碱性磷酸酶高，需要针对甲亢进行治疗，如使用抗甲状腺药物等，随着甲亢病情得到控制，碱性磷酸酶水平也可能随之下降。