HPV6型病毒转阴后存在复发可能性。HPV6型病毒和其他HPV病毒一样，都无法形成终身免疫，如果转阴后不注重个人卫生且性生活混乱，那么复发几率会较高。HPV即人乳头瘤病毒，其包含一百多型，因不同型号的HPV病毒引发宫颈癌及癌前病变的概率各异，所以分为高危型和低危型两类。HPV6型病毒属于低危型HPV病毒，危害性相对较小，也较易转阴，不过转阴后确实可能复发。
一、若患者平常不注意个人卫生，其性生活比较杂乱，那么再次感染HPV6型病毒的可能性极大。
二、HPV6型病毒的反复感染属于持续感染，这有可能会诱发宫颈癌以及癌前病变，所以当出现这种情况时必须要提高警惕，积极开展宫颈TCT检查，必要时可进行阴道镜检查以及宫颈活检，以明确是否存在宫颈癌前病变。
总之，HPV6型病毒转阴后并非一劳永逸，仍需注意个人卫生和性生活状况，对于可能的复发要保持警惕并做好相应检查和防范。