怀孕11周时丙氨酸氨基转移酶（ALT）为90U/L是否严重，需要结合其他检查结果、症状以及具体情况来判断，可能的情况如下：
1.正常情况：ALT是肝功能检查中的一项指标，正常参考范围为9-50U/L。怀孕11周时，ALT为90U/L可能是正常的生理性升高，例如：
怀孕：怀孕后，孕妇的肝脏负担会增加，可能导致ALT水平轻度升高。
其他因素：剧烈运动、过度劳累、饮酒、服用某些药物等也可能引起ALT升高。
2.异常情况：如果除了ALT升高外，还伴有其他症状，如乏力、恶心、呕吐、食欲不振、黄疸（皮肤、巩膜发黄）等，或者有肝脏疾病史，或者ALT升高的程度较高（如超过正常范围的2倍以上），则可能存在肝脏疾病，需要进一步检查和治疗，常见的疾病包括：
病毒性肝炎：如乙肝、丙肝等，可通过血液传播、性传播、母婴传播等方式感染。
药物性肝损伤：某些药物可能会损害肝脏，导致肝功能异常。
自身免疫性肝病：如自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化等，与自身免疫功能异常有关。
妊娠期肝内胆汁淤积症：多发生在妊娠中晚期，主要表现为皮肤瘙痒和黄疸。
此外，ALT升高的程度还可能受到一些因素的影响，如检测方法、检测时间、饮食等。因此，如果对ALT升高的结果有疑虑，建议咨询医生，医生会根据具体情况进行评估，并给出相应的建议和处理方案。
需要注意的是，怀孕期间肝脏的负担会增加，孕妇应注意休息，避免过度劳累和饮酒，避免服用可能损害肝脏的药物。同时，应按时进行产前检查，密切监测肝功能和胎儿的发育情况。如果出现其他异常症状，应及时就医。