早上起来肚子疼通常可能是以下原因导致：
一、受凉：这主要是由于患者晚上睡觉时腹部受冷。当腹部受凉后，腹部内壁的血管会收缩，引发痉挛，于是就会出现早上起来肚子疼的状况。
二、肠道菌群失调：在肠道菌群失调时，会使患者肠道蠕动的速度变快，从而导致早上起来肚子疼。同时，还可能因这种失调而出现便秘、腹泻、口臭等症状。
三、急性肠胃炎：如果患者在前一天进食了不卫生的食物或者刺激性食物等，就会因为细菌或病毒等的刺激而产生肚子疼的现象。并且，还可能伴随有恶心、呕吐、腹泻等表现。
此外，像缺血性肠病等其他情况也会致使患者早上起来肚子疼。因此，建议患者一旦出现此症状，要及时就医检查，明确病因后，在医生指导下进行相应的处理。
总结概况提示：本文阐述了早上起来肚子疼的几种常见原因，包括受凉、肠道菌群失调、急性肠胃炎等，同时也提到其他疾病也可能引发该症状，强调了及时就医明确病因并进行处理的重要性。